南通大學公共衛(wèi)生學院前身是南通醫(yī)學院衛(wèi)生學教研室，1986年8月成立南通醫(yī)學院衛(wèi)生系，2004年5月合并組建南通大學后，成立南通大學公共衛(wèi)生學院。

學院2003年獲二級學科碩士學位授予權（流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學），2011年獲一級學科碩士學位授予權（公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學），公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學學科是南通大學博士學位培育學科；現(xiàn)有在校碩士研究生（含留學生）69人。學院開設預防醫(yī)學、醫(yī)學檢驗技術2個全日制本科專業(yè)，預防醫(yī)學專業(yè)是國家級特色專業(yè)建設點、江蘇省品牌專業(yè)、江蘇省特色專業(yè)、江蘇省“十二五”高等學校重點專業(yè)；醫(yī)學檢驗技術專業(yè)是江蘇省“十二五”高等學校重點專業(yè)、南通大學特色專業(yè)；共有在校本科生822人。學院人才培養(yǎng)特色鮮明，成效顯著，30多年來為國內外培養(yǎng)了大批優(yōu)秀的公共衛(wèi)生專業(yè)人才。近年來學生多次在國家級賽事上榮獲大獎。

學院擁有省部共建實驗室1個（公共衛(wèi)生實驗中心），省級公共服務平臺1個（南通通大化學物安全性評價中心），江蘇省實驗教學示范中心1個（生命化學實驗課教學中心），校級創(chuàng)新服務平臺1個（公共衛(wèi)生技術服務與創(chuàng)新平臺），校級研究所2個（生命分析化學研究所、檢驗醫(yī)學研究所）。南通通大化學物安全性評價中心獲農業(yè)部農藥登記毒理學試驗單位C級資質，通過實驗室資質認定（計量認證），是具有第三方公正地位的檢測機構，2009年獲國家中小企業(yè)公共技術服務補助資金資助，被省經(jīng)信委、省中小企業(yè)局、省科技廳確認為江蘇省中小企業(yè)技術服務示范平臺，先后獲得近500萬的各類資助。

學院教學科研工作實驗條件優(yōu)良。現(xiàn)有教學科研用房3000余平方米，教學科研儀器設備總值1600多萬元，擁有PCR分析儀、流式細胞分析儀、原子吸收分光光度計、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、熒光分光光度計、紫外可見分光光度計、電化學工作站、電泳凝膠圖像分析儀、核酸蛋白定量檢測儀、微型同位素檢測儀、全自動電子天平、全自動生化分析儀、血細胞分析儀、尿液分析儀，r計數(shù)儀、熒光倒置顯微鏡等多種精密儀器，另有60座計算機房和45座數(shù)碼顯微互動教學系統(tǒng)（網(wǎng)絡版）各1個。

學院設有流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學系、職業(yè)衛(wèi)生與環(huán)境毒理學系、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學系、醫(yī)學檢驗系和預防醫(yī)學教研室5個系（室）和1個公共衛(wèi)生實驗中心。現(xiàn)有教職工83人，其中專任教師62人，教授11人，副教授21人，教師博士化率為75.4%。學院現(xiàn)有碩士生導師37人，博士生導師2人。近5年，先后承擔國家級重點科技項目子項目、國家自然科學基金等各級各類科研項目100余項，經(jīng)費總計3000多萬元。在國內外高水平核心期刊上發(fā)表論文300余篇，其中SCI收錄論文單篇最高影響因子33.38，獲市廳級以上成果獎近30項。學院現(xiàn)有江蘇省特聘教授1人，江蘇省醫(yī)學領軍人才1人，江蘇省“333工程”培養(yǎng)對象3人，江蘇省高?！扒嗨{工程”培養(yǎng)對象5人（其中中青年學術帶頭人4人，優(yōu)秀青年骨干教師1人），江蘇省“六大人才高峰”高層次人才選拔培養(yǎng)對象10余人，另有多名國家級人才擔任學院特聘教授。學院是江蘇省預防醫(yī)學會理事單位、江蘇省環(huán)境誘變劑協(xié)會理事單位、南通市農藥協(xié)會理事單位。有2人擔任教育部高等學校公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學專業(yè)類教學指導委員會委員，1人擔任教育部高等學校醫(yī)學技術類教學指導委員會委員，有6人擔任國家級及省級期刊雜志副主編、編委及常務編委，有5人在省部級學會擔任副理事長、理事職務。