生態(tài)學(xué)本科專業(yè)成立于2003年，依托水生生物學(xué)國家重點學(xué)科，由系（生態(tài)學(xué)系）所（水生生物研究所）合一負責(zé)專業(yè)建設(shè)，2004年招收第一屆本科生。本專業(yè)以服務(wù)地方和國家生態(tài)建設(shè)為主導(dǎo)，圍繞國家及地方在水域生態(tài)環(huán)境保護和水生資源開發(fā)利用等方面的重大需求開展教學(xué)、科研及平臺建設(shè)。依托暨南大學(xué)水生生物國家重點學(xué)科，根據(jù)我國尤其是珠三角及港澳地區(qū)社會經(jīng)濟發(fā)展對生態(tài)學(xué)專門人才的需求，充分利用在水域生態(tài)學(xué)理論、富營養(yǎng)化及生態(tài)修復(fù)理論與方法等領(lǐng)域長期積累的理論和實踐優(yōu)勢，培養(yǎng)具有扎實專業(yè)基礎(chǔ)知識、實踐創(chuàng)新能力，尤其是在水域生態(tài)學(xué)及相關(guān)實驗技能方面具備明顯理論及實踐優(yōu)勢的高素質(zhì)生態(tài)專業(yè)人才。2010年獲批建設(shè)廣東省高等學(xué)校特色專業(yè)。