東南大學交通學院成立于1995年，其前身可追溯到上世紀二、三十年代的國立東南大學交通運輸系及國立中央大學土木工程系的路工組、五十至八十年代南京工學院土木工程系的道路教研組、1987年成立的運輸工程研究所、1989年成立的交通運輸工程系。

 交通學院現(xiàn)設有7個系、3個研究中心及2個產(chǎn)業(yè)機構(gòu)，擁有“交通運輸工程”學科博士后科研流動站、“交通運輸工程”一級學科國家重點學科、一級學科博士點，以及土木工程一級學科博士點（與土木學院共建）、九個二級學科博士點和十三個碩士點，設有6個本科專業(yè)。