第二臨床醫(yī)學(xué)院定位于廣東醫(yī)科大學(xué)東莞校區(qū)，設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、康復(fù)治療學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)技術(shù)等四個(gè)專業(yè)。其中臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)是“全國高等學(xué)校特色專業(yè)建設(shè)點(diǎn)”、“廣東省名牌專業(yè)”、“廣東省高校重點(diǎn)專業(yè)”、“廣東省應(yīng)用型人才示范專業(yè)”、一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)和博士點(diǎn)，面向全國招收碩士、博士研究生。臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科排名進(jìn)入ESI全球5‰，2016年臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科獲得廣東省“攀峰”重點(diǎn)學(xué)科，2019年臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)入選國家一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)通過教育部專業(yè)認(rèn)證,有效期為6年。

學(xué)院設(shè)有口腔醫(yī)學(xué)院、康復(fù)醫(yī)學(xué)院、內(nèi)科學(xué)與診斷學(xué)教研室、外科學(xué)教研室、婦產(chǎn)科學(xué)與生殖醫(yī)學(xué)教研室、兒科學(xué)教研室、神經(jīng)病與精神病學(xué)教研室、放射與超聲診斷學(xué)教研室、科研平臺(tái)、口腔醫(yī)學(xué)3D打印重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，擁有規(guī)模大、設(shè)備齊全、特色明顯的臨床技能培訓(xùn)中心。學(xué)校現(xiàn)有7所直屬附屬醫(yī)院作為臨床教學(xué)基地，并與深圳、中山、惠州、東莞、廣州等地十幾家教學(xué)醫(yī)院建立了良好的協(xié)同育人教學(xué)合作關(guān)系。

    學(xué)院秉承“立志立德、求真求精”的校訓(xùn)，弘揚(yáng)“醫(yī)德與醫(yī)術(shù)相長，人文與科學(xué)并重”的專業(yè)理念，堅(jiān)持“臨床實(shí)踐能力培養(yǎng)5年（4年）不斷線，人文素質(zhì)教育5年（4年）不斷線，創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)能力培養(yǎng)5年（4年）不斷線”的培養(yǎng)特色，著力培養(yǎng)基礎(chǔ)知識(shí)扎實(shí)、臨床實(shí)踐能力強(qiáng)、人文素養(yǎng)高、具有創(chuàng)新意識(shí)的應(yīng)用型醫(yī)學(xué)人才。畢業(yè)生以良好的人文素質(zhì)、扎實(shí)的理論基礎(chǔ)和熟練的臨床技能深受用人單位的歡迎，就業(yè)率均在95%以上，大部分畢業(yè)生在珠三角地區(qū)就業(yè)。學(xué)院學(xué)風(fēng)敦厚，學(xué)生考研升學(xué)率逐年提升，2021年臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)生上線率69.88%,錄取率82.76%，總體升學(xué)率54.86%，部分學(xué)生被北京大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、中山大學(xué)等知名大學(xué)錄取。